目前重庆两江游发船码头一共有两个，分别为洪崖洞码头和朝天门码头。其中交运系列和朝天系列登船地点位于洪崖洞码头，金碧系列登船码头为朝天门码头。
重庆两江游船路线和登船地点
1、朝天系列（朝天门号、朝天宫号）
登船及下船地点：洪崖洞1号码头和2号码头（根据现场班次为准）
路线：洪崖洞客运码头出发→洪崖洞→千厮门大桥→重庆大剧院→来福士→东水门大桥→湖广会馆→长江索道→南滨路→慈云寺→朝天门广场→两江汇流→洪崖洞客运码头下船。
2、交运系列（明珠、交运明月、满江红号）：
登船及下船地点：洪崖洞2号码头
路线：洪崖洞客运码头出发→洪崖洞→千厮门大桥→重庆大剧院→来福士→东水门大桥→湖广会馆→长江索道→南滨路→慈云寺→朝天门广场→两江汇流→洪崖洞客运码头下船。
3、金碧系列（金碧皇宫、金碧女王号）
登船及下船地点：朝天门9号码头
路线：朝天门码头→重庆大剧院→洪崖洞→重庆科技馆→两江汇流→南滨路→湖广会馆→慈云寺→千佛寺→重庆东水门大桥→海棠烟雨公园→朝天门码头。