采集指纹按照先右手、后左手的顺序轮流进行，每只手各采集1枚指纹。手指优先顺序为：拇指、食指、中指、环指和小指。如无特殊情况，应当采集申请人双手拇指指纹。拇指无法采集到有效指纹信息时，则按指位顺序依次采集该手的其他手指，直至采集到有效的指纹信息。
当一只手无法采集到有效的指纹信息时，可采集留存另一只手有效的2枚指纹信息。当有效的指纹信息不足2枚时，应当按指位优先高低提取不足数量的指纹图像。
申请办理电子普通护照必须要采集指纹吗
按规定，十六周岁以上的公民申请电子普通护照，公安机关出入境管理机构均应当现场采集申请人的指纹信息。不满十六周岁的公民申请电子普通护照，监护人同意提供申请人指纹信息的，公安机关出入境管理机构可以现场采集。
申请人因指纹缺失、损坏无法按捺指纹的，可以不采集指纹信息。其中，申请人因手指伤病无法捺印指纹且受理机关无法判断的，需提交二级以上医院出具的证明，并在手指伤病痊愈后到受理机构换发护照、补采指纹。